SDS-PAGE (sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis) è una tecnica di separazione delle proteine basata sulla loro carica e massa molecolare utilizzando un gel di poliacrilammide.
Nella tecnica SDS-PAGE, le proteine vengono denaturate e caricate su un gel di poliacrilammide congelato. Il poliacrilammide funge da matrice elettroforetica che separa le proteine in base alla loro dimensione, mentre il SDS agisce come detergente che denatura e carica negativamente le proteine, permettendo loro di migrare nell'elettroforesi.
Le proteine vengono solitamente ridotte e denaturate prima di essere caricate sul gel, tramite l'aggiunta di un agente riducente come il dithiothreitol e un agente denaturante come il SDS. Il SDS denatura le proteine e le carica negativamente in base al numero di residui di amminoacidi presenti, fornendo loro un carico uniforme rispetto alla loro massa molecolare.
Dopo il caricamento delle proteine sul gel, viene applicato un campo elettrico che induce la migrazione delle proteine verso l'anodo (verso il polo positivo) lungo il gel di poliacrilammide. Le proteine più piccole migreranno più velocemente rispetto a quelle più grandi, poiché incontrano meno resistenza gel durante la loro migrazione.
Una volta che le proteine migrano attraverso il gel, possono essere rilevate attraverso varie tecniche, come la colorazione con coloranti come il Coomassie Blue o l'argento. Le proteine possono anche essere trasferite su una membrana per una successiva rivelazione mediante l'uso di anticorpi specifici o marcatori fluorescenti.
L'SDS-PAGE viene ampiamente utilizzato in laboratorio per analizzare e separare le proteine in base alla loro massa molecolare, consentendo una caratterizzazione più approfondita dei loro singoli componenti. Questa tecnica è fondamentale per studiare le proprietà strutturali e funzionali delle proteine in diversi settori della biologia e della biochimica.
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